Волею судеб моей миссией стала подготовка deb-пакета. Ну, я его собираю-ставлю-пробую-удаляю-снова ставлю-удаляю и так далее. На каком-то шаге после удаления пакета обратил внимание на то, что конфиги (которые были записаны в /etc/blablabla) не удаляются. Ну удалил руками их и дело с концом. Но при переустановке пакета они не появились. Вот тут-то и начались мытарства.

Штирлиц постучал в дверь. Никто не ответил. Штирлиц постучал сильнее. Реакции не последовало. Штирлиц начал пинать дверь кованым сапогом. Дверь не поддавалась. «Закрыто» – подумал Штирлиц.

Так и я, через час бессмысленных проб и ошибок понял, что скорее всего конфиги я удалил зря, и вообще при переустановке они, похоже, не обновляются.

Оказалось, для того, чтобы удалить конфиги пакета, нужно выполнить

dpkg --purge <имя пакета>

После этого менеджер пакетов поставит где-то в своей базе флажок «конфигов для этого пакета больше нет», и при переустановке они будут заново разложены по директориям.