Для взаимодействия с 32-разрядной COM библиотекой через jni4net понадобилось, чтобы приложение запускалось с помощью 32-разрядной JDK. Скачал, поставил, и напоролся на то, что установленная 32-битная версия 1.7_25 полностью заменила все имеющиеся JDK, закинув exe-файлы java.exe, javaw.exe прямо в Windows\System32. А мне хотелось, чтобы по умолчанию работала 64-разрядная версия. И только в определённых приложениях запуск производился с помощью 32-битной JVM. Нашел следующее решение:

• Удаляем из System32 три exe файла, появившихся после инсталляции 32-битной JDK
• Устанавливаем JAVA_HOME на 64-разрядную JDK. В Path прописываем путь к директории bin этой же 64-разрядной JDK. Это будет JDK по умолчанию.
• В приложениях, которые требуют запуска с использованием недефолтной JDK, прописываем следующие строки в скрипт запуска:

  set JAVA_HOME=путь к JDK
set PATH=%JAVA_HOME%\bin;%PATH%

Вот и всё! Теперь у нас в приложениях, где этих строк нет, будет запускаться дефолтная версия JVM, а в приложениях, которые мы сконфигурировали явно, будет стартовать именно та версия, которую мы прописали.